多肽DFVVAVKR的參數和合成路線|三字母為Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|專肽生物產品-定制多肽合成服務
文章目錄
一、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的結構圖
二、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的多肽參數
三、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的靜電荷圖
四、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg|DFVVAVKR的合成步驟
專肽生物官網:http://amynixphotography.com (以下圖片均由專肽生物多肽結構計算器自動生成)
一、Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg的結構圖如下
二、Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg的多肽參數如下
單字母:H2N-DFVVAVKR-OH
三字母:H2N-Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg-COOH
中文序列:天冬氨酸-苯丙氨酸-纈氨酸-纈氨酸-丙氨酸-纈氨酸-賴氨酸-精氨酸
氨基酸個數:8
分子式:C43H72N12O11
平均分子量:933.11
精確分子量(Exact Mass):932.54
等電點(PI):9.7
pH=7.0時的凈電荷數:0.98
GRAVY值:0.66
親水殘基比例:0.1
消光系數:-
平均親水性及多肽溶解建議:親水(該多肽在純水中溶解性較好,大多數情況下無需助溶)
三、H2N-DFVVAVKR-OH的靜電荷圖
四、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.3g CTC Resin(如初始取代度約為1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反應器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入樹脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反應2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質,有利于后續(xù)反應)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin備用。結構圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色)。結構圖如下:
3、縮合:取2.7mmol Fmoc-Lys(Boc)-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應30分鐘后,用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應做準備)。得到Fmoc-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結構圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin
最后再經過步驟二得到 H2N-Asp(OtBu)-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-CTC Resin,結構圖如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品 Asp-Phe-Val-Val-Ala-Val-Lys-Arg。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復測下純度 是否目標純度。
七、最后總結:
杭州專肽生物技術公司定制多肽合成業(yè)務:熒光標記肽(Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),同位素標記(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(p-Ser、p-Thr、p-Tyr),環(huán)肽(酰胺環(huán)、一對或多對二硫鍵環(huán)及定點成環(huán)),生物素標記肽(BIOTIN),復合抗原肽(MAP4、MAP8、MAP16),螯合劑(HYNIC),小分子化合物,PEG修飾,熒光淬滅基團標記(EDANS、DABCYL),甲基化修飾(Lys、Arg),光敏劑修飾,DOTA,NOTA,DOPA,疊氮修飾,兩支不同序列的分支肽,兩條不同序列多肽之間的多對二硫鍵等。
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