多肽的兩端假如不封端的話,就會攜帶游離的氨基(N端)和游離的羧基(C端),而多肽的序列往往代表了母本蛋白的序列,為了與母本蛋白更為接近,多肽的兩端往往需要封閉,即N端乙?;虲端酰胺化,這些修飾會減少多肽的總電荷,降低多肽的溶解度,也可以使多肽模擬它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始狀態(tài)。
下面,我們用多肽結構計算器 來展示下多肽N端乙?;投嚯腃端酰胺化。
例如我們隨便給個序列RGDRGD,這種寫法,代表左邊N端是氨基形式,右邊C端是羧基形式
輸入到多肽結構計算器中,得到下圖
左邊的氨基H2N 具有正電荷,右邊的羧基COOH 具有負電荷。其水溶解性相對封端之后的 要好很多。
那么假如RGDRGD 進行N端乙?;虲端酰胺化之后,會是怎樣子的?
序列寫法有很多種,例如Ac-RGDRGD-NH2;
Ac可以替換為Acetyl、乙?;?、Acetylated、Acetylation等
NH2可以替換為 CONH2、酰胺化、amide等
輸入到多肽結構圖計算器中,得到下圖
此時多肽的兩端沒有電荷了,更像它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始狀態(tài),不過多肽的水溶解度降低了。
溫馨提示:您在文獻中查閱多肽序列時,需要注意下多肽的兩端是否有封端的說明。