FITC(異硫氰酸熒光素酯)是多肽，抗體蛋白常用的熒光標記物（入射波長492nm，發(fā)射波長518nm），一般修飾在多肽的N端或者序列中賴氨酸的側(cè)鏈上，在我們固相合成過的FITC修飾肽中，只要出現(xiàn)在序列N端的，我們在修飾FITC之前都會插入一個Linker，而在序列賴氨酸側(cè)鏈修飾的時候，往往都不需要插入linker，下面我們通過圖文介紹下這其中的原因。

Edman 降解(Edman degradation)，從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被異硫氰酸苯酯修飾，然后從多肽鏈上切下修飾的殘基（此殘基就是直接與PITC相連接的氨基酸），再經(jīng)層析鑒定，余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環(huán)。

所以如果FITC直接修飾在N端氨基的時候，在切割過程中時候發(fā)生Edman degradation反應(yīng)，如下圖。

為了避免這個副反應(yīng)的發(fā)生，我們在N端標記的時候一定要加一個linke，如2-氨基乙酸，3-氨基丙酸，6-氨基己酸，目前我們常用的是6-氨基己酸，應(yīng)為較長的碳鏈可以降低對活性中心的影響，同時又能很好的與FITC反應(yīng)。所以賴氨酸側(cè)鏈修飾FITC，我們可以不用加linker。

例如有一個肽段序列為 FSGDCK，三字母為Phe-Ser-Gly-Asp-Cys-Lys

在N端標記FITC，選用最常用的6-氨基己酸為Linker，其結(jié)構(gòu)為

在C端K的側(cè)鏈標記FITC，可以選擇不添加Linker,其結(jié)構(gòu)為

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