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專(zhuān)注多肽 服務(wù)科研
大部分肽段的氨基酸序列,都是由L型氨基酸組成,例如20種天然氨基酸。而相對(duì)應(yīng)的D型氨基酸,其實(shí)運(yùn)用也挺廣泛的,例如
1、環(huán)狀RGD肽:c(RGDfK),小寫(xiě)的f代表D型苯丙氨酸。
2、化妝品多肽中的美立肽(九肽-1),其序列為Met-Pro-DPhe-Arg-DTrp-Phe-Lys-Pro-Val-NH2,含有兩個(gè)D型氨基酸,分別為DPhe和DTrp。
3、一些酶底物如D丙氨酸羧肽酶底物,其序列為Ac-Lys-DAla-DAla,含兩個(gè)D型Ala。
4、包括前幾天介紹的線粒體靶向抗氧化劑SS-31肽,其序列為DArg-Dmt-Lys-Phe-NH2,N端的精氨酸是D型。
5、等等
今天我們主要介紹下D型氨基酸在抗菌肽中的設(shè)計(jì)--L型和D型相間,表現(xiàn)形式有兩種,如LDLD類(lèi)型或者 DLDL類(lèi)型。
例如抗菌肽序列RKRWWVVKRKWWV-NH2,
采用L型和D型相間設(shè)計(jì)之后是RkRwWvVkRkWwV-NH2。
形成穩(wěn)定的短桿菌肽樣螺旋構(gòu)象,具有環(huán)結(jié)構(gòu)的交替的L和D氨基酸的納米級(jí)分子組裝體,其堆疊形成中空管。其活性值高于全L型肽段。
具體描述見(jiàn)PDF文獻(xiàn),含有分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件、靜電勢(shì)分析軟件、三維圖軟件。