Fmoc化學(xué)是由Eric Atherton和Bob Sheppard在1970年代后期在劍橋大學(xué)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的，并經(jīng)過(guò)Chan和White的審查（《 Fmoc固相肽合成–一種實(shí)用方法》，牛津大學(xué)出版社，2000年）。

在Fmoc固相肽合成中，肽鏈逐步連接，一次連接一個(gè)氨基酸，同時(shí)連接至不溶性樹(shù)脂載體。這允許在每個(gè)步驟通過(guò)簡(jiǎn)單的洗滌除去反應(yīng)副產(chǎn)物。氨基酸在其氨基末端被Fmoc（9-芴基甲氧基羰基）基團(tuán)保護(hù)，并在羧酸末端活化后與生長(zhǎng)鏈偶聯(lián)。然后通過(guò)哌啶處理除去Fmoc基團(tuán)并重復(fù)該過(guò)程。肽組裝完成后，可通過(guò)用三氟乙酸（TFA）處理將其從樹(shù)脂上除去。同時(shí)，氨基酸側(cè)鏈上的保護(hù)基也被除去，得到粗線性肽。通過(guò)反相HPLC一步純化通常足以獲得純度> 95％的肽。

Fmoc合成反應(yīng)溫和，靈活且用途廣泛，因此比替代Boc化學(xué)方法提供了更多的合成選擇。例如，TFA在裂解過(guò)程中僅使用一次，而在Boc過(guò)程中，每個(gè)周期都使用它。